(1)内设机构10个，分别是：秘书处、人事处、研究一处、研究二处、研究三处、省志指导处、市县志指导处、年鉴工作处、宣传教育处、科研管理处。规格均为正处级。

机关党委，主要负责直属单位的党群工作。

(2)下辖一个正处级公益一类事业单位，即福建省革命历史纪念馆（中央苏区〈福建〉纪念馆），承担福建革命、建设、改革开放时期革命历史文物、照片、史料的征集研究、陈列展览、保护收藏、宣传教育等工作。

(3)下辖一个副处级公益一类事业单位，即福建省方志馆，负责志书、年鉴和地情资料的收集、整理、保存、借阅、检索咨询，开展省情地情及地方志成果展示展览、学术交流等工作。